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用限制性内切酶切割目的样本的基因组DNA,可以得到大量的DNA片段。将这些DNA片段与相应载体连接,转化入受体细胞,并培养使其大量复复制。这样,一个克隆内每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组DNA的全部基因片段,即基因组文库。
在基因组测序中,建库测序是对提供的合格样品进行建库并运用illumina测序平台测序,产生高质量的测序数据,从而为客户进行生物信息学分析提供原始数据依据。
专业专注:10余年医学科研行业经验,课题项目皆由3年以上的专业科研人员负责
服务透明:项目反馈及时,阶段性说明实验项目进展情况,客户无后顾之忧
硬件保障:实验场地及相关设备对所有客户开放,欢迎随时参观
结果保证:保证所有课题实验数据的真实性、客观性
优质资源:学术资源丰富,涵盖生物医学大多数专业,根据不同需求,提供个性化辅导协助
保密制度:严格执行保密规程,充分保护客户隐私信息,诚信签订保密协议
正规发票:提供支付宝、微信、银联等多种便捷支付方式,可出具正规增值税发票
序列 | 服务内容 |
1 | 构建基因组测序所需要的基因组文库 |
1、细胞、新鲜组织或总RNA/DNA样品
2、细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)直接液氮冻存后,-80℃保存
3、样品运输:细胞或者组织样品;或者总RNA样本/DNA样本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输
备注:不同测序方法,对样本的要求不相同,请根据测序手段来确定送样要求
14天
根据样品类型和数量面议定价
全基因组DNA甲基化测序采用亚硫酸氢盐处理基因组DNA使未甲基化修饰的Chemicalbook胞嘧啶C转化为尿嘧啶U,通过对处理后的DNA进行全基因组重测序,并与参考基因组进行比对,从基因组水平实现单碱基分辨率的、高精确度甲基化水平分析。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。
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序列 | 服务内容 |
1 | 测序数据质量评估 |
2 | 与参考基因组比对 |
3 | 甲基化位点calling |
4 | 甲基化分布 |
5 | 差异甲基化分析 |
6 | 相关基因分析 |
7 | 多样本分析 |
1、细胞,组织,总DNA等
2、建议起始量(单次):DNA>10ug,样品浓度>50ng/ul, OD260/OD280在1.8到2.0之间
45天
根据样品类型和数量面议定价
ChIP-seq:是一种将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。ChIP是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具。ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
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序列 | 服务内容 |
1 | 测序数据质量评估 |
2 | 与参考基因组比对 |
3 | peak峰calling |
4 | motif分析 |
5 | peak峰相关基因注释 |
6 | 差异peak分析 |
7 | 相关基因功能分析 |
1、细胞≥2×107个;动物组织量≥200mg;植物组织量:叶片≥1.5g,茎≥2 g。
2、IP产物及input:浓度>0.1ng/uL,体积≥15uL,片段长度200-500bp;通常input浓度≥50ng/uL,体积≥15uL(其它情况请联系我们技术支持沟通)。
3、ChIP文库浓度≥10nM,体积≥20μL,片段长度200-500bp。
45天
根据样品类型和数量面议定价
lncRNA测序:通过lncRNA测序可以研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有lncRNA和mRNA,并进行相关生信分析。
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序列 | 服务内容 | |
lncRNA分析 | 原始数据和结果报告图表 | |
1 | lncRNA拼接组装 | |
2 | lncRNA位点筛选 | |
3 | lncRNA编码潜能分析 | |
4 | lncRNA描述性统计 | |
5 | lncRNA靶基因预测 | |
6 | lncRNA保守性分析 | |
7 | ORF长度分析及exon个数分析 | |
8 | 表达水平分析及差异表达分析 |
1、细胞,组织,全血,总RNA等
2、建议总RNA起始量:10ug,最低5ug,人/大鼠/小鼠样品可低至1ug,
3、浓度≥200 ng/uL(人/大鼠/小鼠样品可低至≥50ng/ul)
45天
根据样品类型和数量面议定价
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA。通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,目前已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。
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1 | 基因结构水平分析 |
2 | 与参考基因组比对 |
3 | 新转录本预测 |
4 | 可变剪切分析 |
5 | SNP分析 |
6 | InDel分析 |
1、细胞,组织,全血,血清,血浆,总RNA等
2、建议总RNA起始量:2ug,最低1ug,浓度≥50ng /uL
40天
根据样品类型和数量面议定价
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类特殊的非编码RNA,它大量存在于真核细胞胞质内。近几年的研究表明,circRNA在生物的生长发育、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。在功能上,circRNA分子富含microRNA(miRNA)结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,从而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平;这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。通过与疾病关联的miRNA相互作用,circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。
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序列 | 服务内容 |
1 | 参考序列比对 |
2 | circRNA鉴定 |
3 | circRNA来源基因分析 |
4 | circRNA表达水平定量 |
5 | 差异表达分析 |
6 | GO、KEGG富集分析 |
7 | miRNA结合位点预测 |
1、细胞,组织,全血,总RNA等
2、建议总RNA起始量:10 ug,最低5ug,浓度≥200 ng/uL
70天
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扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获片段进行测序,对环境样本进行16s、ITS、18s高变区扩增产物测序,通过检测目的区域的序列变异和丰度,可研究环境中微生物的多样性及群落组成差异。
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1 | 物种注释 |
2 | α-多样性分析 |
3 | β-多样性分析 |
4 | 多元统计分析 |
5 | CCA分析 |
6 | 环境因子关联分析 |
7 | VPA分析 |
8 | 功能预测 |
9 | 肠型分析 |
10 | 贝叶斯网络图 |
11 | Source Tracker |
【样本要求】
1、菌体,DNA等
2、建议总DNA起始量:>20ng(较纯DNA,无宿主及其他杂质污染)
10天
根据样品类型和数量面议定价
宏基因组学(Metagenomics)通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA并测序,利用组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的群落组成及其群落(基因)功能。
宏基因测序是通过高通量测序技术对环境样品中全部微小生物遗传物质,包含了可培养的和未可培养的微生物的基因组进行测序分析,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。
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1 | 测序数据质量评估 |
2 | 基因预测 |
3 | 物种、功能注释 |
4 | CARD |
5 | CAG/MLG分析 |
6 | CNV(copy number variation) |
7 | 噬菌体 |
1、环境样品,总DNA等
2、建议总DNA起始量:5 ug,最低0.5ug,浓度≥30 ng/uL(Qubit定量)
26.5天
根据样品类型和数量面议定价